毛文龙向王化贞报捷，王得报，飞传北京，“报闻之日，缙绅庆于朝，庶民庆于野。“自清抚失守以来，明已费去千百万金钱，集结十数万兵力，却不能擒其一人！毛文龙复镇江，举朝视为一大“奇捷“，“真为空谷之音“王在晋：《三朝辽事实录》，卷5。。狂喜之下，朝廷立授毛文龙为广宁都司，兼副总兵，赏银二百两。应毛文龙要求，王化贞请求朝廷速发援兵和饷银，乘势大举反攻。熹宗发布命令：登莱巡抚陶朗先发水兵先行，天津巡抚毕自严调浙江水兵八千为后劲，或直抵镇江，或直抵三岔河。王化贞选精兵四万据三岔河，相机进兵。令熊廷弼勒兵控扼山海，“三方协力，务收全胜“。但熊廷弼对毛文龙取镇江持完全否定的态度，对此番大举并不积极。因此，命令下达后，“经、抚各镇观望不进“《明熹宗实录》，卷8。，遂使这一部署化为泡影。
毛文龙以小股部队成功地突袭镇江，努尔哈赤十分震惊，他不得不推迟向辽西的进军，特派他的八子皇太极、侄儿阿敏率三千人马赶往镇江弹压。明援兵不至，朝鲜不敢出师支援，毛文龙坐守孤城，不堪后金围攻，得而复失。毛文龙于城陷前二天只身逃往朝鲜。皇太极率军进城，屠戮男妇百姓王在晋：《三朝辽事实录》，卷6。参见《满文老档》，卷24，太祖天命六年七月。。他还遵从其父努尔哈赤的命令，把镇江等地沿海居民都迁到内地《清太祖武皇帝实录》，卷3。。尽管如此，仍有三万余人逃到朝鲜避难王在晋：《三朝辽事实录》，卷6。。与此同时，努尔哈赤又派他的二子代善率数千将士赶到金州，将城楼、垛口都拆平，原明官员的衙门房屋、民居及乡屯民居都付之一炬，尽行烧毁，强制这些无家可归的百姓迁到复州去王在晋：《三朝辽事实录》，卷5。。
毛文龙退入朝鲜，后金兵随后渡江，进入朝鲜境内，“喝本国（按：指朝鲜）大索文龙“。李肯翊：《燃藜室记述》，卷21，《毛文龙入椴岛》。朝鲜坚持与明朝保持友好的关系，极力保护毛文龙，免遭搜捕。其后，毛文龙在朝鲜虽未立足，仍然组织避难辽人袭击后金兵。努尔哈赤视为心腹之患，不断派人秘密潜入朝鲜，探听毛文龙的下落。他给凤凰城守下达指令，命他密探毛文龙是在海岛，还是在朝鲜某城，要取得准确消息，速来奏报。不久，探明毛文龙、陈良策等住朝鲜龙川。于是，努尔哈赤致书朝鲜，胁迫其国王将他们逮捕送来，否则，将以兵进讨《满文老档•太祖朝》，卷30。。毛文龙来朝鲜，使朝鲜处于十分为难的境地。它认识到，毛文龙之来，实启朝鲜“不测之祸“，必招来后金加兵朝鲜，其国王和众臣十分惧怕；但又不能开罪明朝，以失其传统的亲密之谊。它仍采取劝其“姑还广宁，待时出来“的方针，劝文龙离开朝鲜。毛文龙却无意离开，只好将就毛文龙的主意，留了下来。后金却“搜索甚急“，一再发出恫吓，朝鲜置之不理《光海君日记》5，十三年十月丁丑。。同年十二月十五日，数千后金兵渡江，暗渡义州，“猝袭毛总兵“，毛文龙已不在龙川，转移到距龙川九十里的林畔馆地方。毛文龙不及防，“脱冠服混兵士仅免“《光海君日记》5，辛酉十三年十二月乙酉。，脱身南行至安州。后金兵进至郭山，没有搜到毛文龙，“逢汉人则无论老幼皆斩之而还李肯翊：《燃藜室记述》，卷21，《毛文龙入椴岛》。“。据朝鲜统计，“汉人男女被杀五百七十八人“《光海君日记》5，壬戌十四年正月辛丑。。
第五部分明在辽东沿海的防御（4）
毛文龙得到朝鲜的庇护，总算摆脱了后金的一再追捕。他着手组织军队，建立抗击后金以收复辽东的根据地。他先后在蛇浦、椴岛设栅，广泛“收招汉人“，吸引了很多逃难的辽民和商人前来居住。在蛇浦，已聚万余户；在椴岛，“人户甚盛“李肯翊：《燃藜室记述》，卷21，《毛文龙入椴岛》。。天启二年六月，为表彰毛文龙的功绩，明朝提升他为署都督佥事平辽总兵官《明熹宗实录》，卷18。。同年十一月，毛文龙选择了椴岛为其大本营，迁居于此。接着，“辽民皆卷入岛中，接屋甚盛，作一都会，南京商船，来往如织。“《光海君日记》5，壬戌十四年十一月癸卯。
椴岛，又称皮岛、稷岛、南海岛，毛文龙来此，改名为云从岛。该岛位于西朝鲜湾北部，紧邻铁山半岛，其北部靠近鸭绿江入海口。岛东西长十五里，南北宽十里。据朝鲜人亲见“岛中形势，回抱东、西、南三面，只开一面。北向中有一峰特立，西向，都督开营于其下，村家罗络，谷中峰头大约三千余户。“《潜谷先生遗稿•朝京日录》卷14，115页。岛上有山，多峭壁，四面环海，易守难攻。由于它居于中国与朝鲜大陆之间，且跟辽东沿海岛屿距离颇近，利用海运，联络甚便，军事上互为声援，转饷运输也不受后金威胁。因此，皮岛是个很理想的据守之所。毛文龙把他的总兵官府邸设于此岛，朝廷予以肯定，号“东江镇“皮岛、旅顺与辽东沿海岛屿的合称。。岛中原“荒茸无人，多蛇虎“，计六奇：《明季北略》，卷2，《毛文龙入皮岛》。毛文龙开府后，皮岛的荒凉面貌迅速改观，“辽民来投者日众，前后数十万口“，还分置铁山、蛇梁等处《燃藜室记述》，卷21，《毛文龙入椴岛》。。经过毛文龙等人的艰苦奋战和朝鲜的有力支持，在后金的大后方建立了一个以恢复辽东为目标的根据地，为明在辽东沿海建设一道新的防线迈出了重要的一步。