华佗除了有很高明的医术以外，还是医疗体育的创始人。他否定了方士可以使人长生不老的鬼话，批评了单纯的医疗观点。他认为每个人都应该进行体育锻炼，来增强体质、预防疾病，以达到延年益寿的目的。根据这个原则，华佗编制了一套五禽戏，华佗把虎的扑动前肢、鹿的伸转头颈、熊的卧倒身子、猿的脚尖纵跳、鸟的张翅飞翔等动作，联系起来，编成一整套使全身肌肉和关节都得到舒展的体操。只要打一套五禽戏，全身的关节、筋骨、肌肉就基本上都活动过了。华佗每天早早起床，在庭院里活动，伸伸胳膊，抬抬腿，弯弯腰，扭扭脖子；看书诊病坐得久了，就站起来活动活动。
华佗有两个徒弟，一个叫吴普，擅长药物学，写了一部专讲药物的书，叫《吴普本草》；另一个叫樊阿，精于针灸。两人都按照华佗的"五禽戏"天天锻炼，吴普活到九十多岁，樊阿也是长寿之人，两人年老时仍耳聪目明，牙齿坚固。华佗把这套锻炼身体的方法，到处推广，使很多的人受到好处。
神医医术失传
曹操得了"偏头痛"的病，半边头痛起来异常难受，没有人治得了。他听说华佗医术高明，就召他到河南许昌，为他治偏头痛。华佗经过细心的诊断和认真的分析，选定穴位扎了几针，就把曹操的偏头痛治好了。曹操很想把华佗留下来，以便华佗能随时为他治病。可华佗不愿意在官府里为他一个人服务，就借口妻子病了，请求回家为妻子治病。曹操答应让他暂时回去，等到妻子病好后立刻回来。
华佗回到家乡就忙于给百姓看病。曹操派人催了几次，他总推托说妻子的病还未好。曹操为此大发雷霆，专门派人到华佗家乡去调查。他对派去的人说："如果华佗的妻子果真有病，就送给小豆四十斛，宽假限日，要有虚假，就逮捕治罪。"不久，华佗被抓到许昌，曹操仍旧请他治病。华佗诊断之后，说："丞相的病已经很严重，不是针灸可以奏效的了。我想给你服麻沸散，然后剖开头颅，施行手术，这才能除去病根。"曹操一听，以为华佗要谋害他。他勃然大怒，厉声斥道："头剖开了，人还能活吗？"于是把华佗关到牢里去准备杀掉。曹操的一位谋士请求说："佗方术实工，人命所悬，宜加全宥。"曹操不听，说："不忧，天下当无此鼠辈邪？"最终将华佗杀害。
华佗临死前一天，把记录他一生行医经验的几部书拿出来，交给看管他的狱卒。希望这些多年积累的宝贵资料能流传下来。可这个狱卒胆小怕事，不敢接受。华佗只好眼含泪水，烧掉了这些资料。现在的《 中藏经 》、《 华佗方 》等医书，虽被人认为是他的著作，实际上却都是后人假托的。华佗的医学著作有《 观形察色并三部脉经 》一卷，《 枕中灸刺经 》一卷，《 华佗方 》十卷，《 华佗内事 》五卷，均已散失。但在五叔和的《 脉经 》和后世《 千金要方 》、《 外台秘要 》中，还可以看到华佗论脉和诊病的一些方法。