此时，蒋介石已不再顾忌得罪美国政府，正式通知罗斯福总统，强烈要求解除史迪威的职务，赶他回国。而美政府经巴顿将军等人出面求情，并由与美关系很深的宋美龄、宋霭龄、宋子文等人向蒋介石施加压力，最后由史迪威到山洞官邸向蒋介石道歉，这场风波才算平息。
这件事对陈诚打击很大，不久他的远征军司令长官的职务就由卫立煌接任。
如果说，陈诚以前只是憎恨戴笠的人品，当手下十六位青年军人被戴笠遵照蒋介石的密令处决后，他开始把戴笠当作自己不共戴天的仇敌。
1942年4月18日，美军十六架B-52轰炸机从距日本本土六百五十海里的航空母舰“大黄蜂”号上起飞，首次实施的珍珠港事件后对日本的报复性轰炸。完成任务后，预定到中国浙江衢州机场降落，无奈对于中国东南沿海气象地形等情况不熟悉。轰炸机飞达浙江上空时正遇狂风暴雨，七十五名机上人员与地面失去联系，飞机油料渐渐耗尽。
在这种紧急情况下，机上人员不得不弃机跳伞。结果，六十七名空中袭击队员被国民党救起，另外八人被日军俘虏。
这次行动使美国海军认定，必须通过与中国军统合作，尽快掌握中国东南沿海地区的水文、地质、地形、气象及日军情况，以利于美国海、空军对日作战。
对于军统来说，和美国合作，一来可以提高身价，二来可以得到美方的援助，提高军统特工技术和力量。最主要的是，戴笠想通过美国方面的支持，实现担任海军总司令的伟大理想和宏伟目标。
戴笠、毛人凤和梅乐斯在杨家山戴笠公馆签订的初步协议内容大致有：中美双方共同成立一个情报机构，名曰“中美特种技术合作所”。合作所以情报合作为业务，中方由军统局为代表，美方由海军部情报署为代表；军统局尽可能供给美方有关日本陆、海、空军在中国沿海及大陆活动的一切情报；协助美方在中国沿海及内地指定地区建立气象站和水文研究机构及无线电台；美方人员在华如有失踪及伤亡意外情况发生时，军统局应协助设法寻找和救护，并保护美方人员在华的安全。美方给军统的条件是：无偿供给军统必要的武器、无线电器材、气象器材和交通、医药器材等。
这个协议和计划，很快得到双方元首的批准。国民政府于1943年1月正式行文批准成立“中美特种技术合作所”。
蒋介石对成立中美合作所在原则上是支持的，他也希望这种合作不断扩大和加强。但是，蒋介石对戴笠与梅乐斯的合作活动又带有一种警惕心理。
蒋介石对一部分美国人企图直接控制国民党军队及政府重要机构的行为给予高度警惕。现在，梅乐斯找上门来要与军统合作，会不会另有所图？蒋介石的疑忌使他始终对于中美合作所采取一种谨慎的支持态度。