3055年8月23日，人类与变异人的战争爆发，变异人虽然自身实力强大，但联邦政府存在了这么久，自然也是底蕴十足，一些政府高层早已经对变异人有了忧虑，他们挑选了一批基因强大的人类进行武装改造，这种改造的成功几率非常低，一旦改造成功就会变得异常强大，成为政府重器，也正是这一批悍不畏死的人类改造者，携带各种先进武器消灭了叛变的变异人。
虽然人类赢了这场战争，但是战争波及的范围极广，四大星球无一幸免，在这场战争中大约有一千万士兵牺牲和三千万平民死亡，数以亿计的人流离失所，造成的经济损失更是不可估量，遍地都是残桓，各行各业百废待兴，人们称这场战争为灭异之战。
联邦政府在这场灭异战争中垮台，正是因为政府支持研究变异人才导致了这场战争，再加上政府在战争期间多次昏庸的指挥让人类损失惨重，以及内部的种种斗争，使得联邦政府无力掌控，不得已宣布垮台，出现十二个由政党或财阀组建而成的国家，彼此独立，控制着四大星球。
联邦政府在垮台前，将每年研究出来的变异人失败品封存到一个秘密的地方，那些尚未研制成功的高等变异人实验品也封存在这个地方，人们将这个秘密的地方称为异源之地，除了封存的几人，没人知道这个地方，而封存变异人的那几个人自联邦政府垮台后，就再也没有出现过。
鉴于高等生物和人类结合后所发挥出来的骇人力量，新成立的十二国政府发表联合禁令，严禁人们进行变异人试验，一经发现，重罪论处，并且将所有关于这项研究的资料全部付之一炬，从而导致人类在这项研究上倒退到最原始的地步。
灭异之战后，世界上掀起了对变异人抓捕，不管变异人对人类有无恶意，全部铲除，即便是变异人的后代，只要身体里存在变异基因者无一幸免，避免再次发生叛乱事件，人类再也经不起战争的后果。
自大规模扫荡变异人后，变异人的数量明显减少，最后很少出现在人类的视野中。即便如此，人类对于变异人的捕杀依旧没有停止。
(本章完)